انجمن علمی زیست شناسی دانشگاه گیلان

پروتئومیک ساختاری ،با استفاده از الگوهای تا شدگی، کنش پروتئین راقیاس می   گیرد.          الگوهای تا شدگی پروتئین که از راه تحلیل داده های بلور شناختی تابش های x، شناسایی می شوند ، اغلب برای درک کنش پروتئین ویژه ای به کار می روند. گرچه با این روش داده های دقیقی پدید می آیند ، اما تولید بلور های پروتئین ، نیاز به مقادیر نسبتا"زیادی پروتئین خالص دارد. باهمه ی اینها ، مدل ساختار اتمی بسیاری ازپروتئین های شناسایی شده با فهرست روز افزونی ، تولید می شود که در بانک داده های پروتئین بایگانی شده است . با وجود این ، میتوان از راهبرد دیگری برای ایجاد مدل سه بعدی پروتئین های تازه کشف شده استفاده کرد که نیاز به نمونه های بلوری پروتئین آزمودنی را برطرف می سازد. در این مدل، ابتدا پروتئین آزمودنی را به صورت قطعه های کوچکی برش می دهند، سپس از طیف سنجی رزونانس مغناطیسی هسته ای (NMR)برای شناسایی ساختار تا شده (ساختار سوم) هر یک از قطعه هااستفاده می کنند. با آشکار شدن تا شدگی های نامبرده ، می توان از روش های محاسبه ای دقیقی برای ترکیب الگوهای تا شدگی قطعه های منفرد به صورت یک مدل سه بعدی استفاده کرد. کنش آنزیم ها را اغلب می توان از روی داده های NMRکه منطقه ی جایگاه آنزیم را ارائه می دهند، استنباط کرد.

                                     منبع : مبانی زیست شناسی مولکولی

                                     تاًلیف جرج ، م . مالا سینسکی